После 1999 года господин Калманович стал работать уже с российскими женскими баскетбольными клубными командами, также добивавшимися побед в Европе. А за несколько месяцев до убийства в 2009 году предприниматель стал генеральным менеджером женской сборной России по баскетболу. Поэтому встречи с людьми из мира баскетбола были для него обычным делом. В день убийства, 2 ноября 2009 года, бизнесмен в своем офисе встретился сначала с господином Черновым. Собеседники были знакомы почти 15 лет, а незадолго до последнего разговора вместе летали на женский чемпионат Европы в Литву. Обсудив развитие детского баскетбола, около 13 часов господин Калманович проводил гостя. Позже в офис заглянула игрок «Спартака» из Видного Ирина Осипова, которая подписала ряд документов. После ее ухода господин Калманович попросил секретаря его не беспокоить. Примерно в 16:35, по материалам дела, секретарь напомнила шефу о запланированной встрече с одним из сотрудников администрации президента. После этого бизнесмен в сопровождении двух охранников подошел к своему черному Mercedes S500, сел на переднее пассажирское кресло и поехал к дому №8 на Старой площади. Через десять минут после отъезда он позвонил секретарю, попросив сообщить ему результаты баскетбольных матчей, однако разговор неожиданно прервался. Еще через пару минут до секретаря дозвонился уже водитель Петр Туманов, который произнес: «Лена, на нас напали. Нас расстреляли». А перезвонив позже еще раз, он сообщил, что господин Калманович убит.

Как установит затем следствие, в 16:45 по Меrcedes, остановившемуся на светофоре на Смоленской набережной около Нового Арбата, был открыт огонь из притормозившей рядом серебристой «Лады-Приоры». Преступники с расстояния в метр выпустили по иномарке 24 пули из армянского пистолета-пулемета К6-92. Как установили позже эксперты, восемь из них попали в Шабтая Калмановича, который погиб сразу же. Еще одна пуля ранила в грудь водителя Мercedes, но тот решил догнать «Приору». Однако, заметив погоню, водитель «Лады» выехал на встречную полосу, резко развернулся и попытался оторваться от преследователя. Погоня продолжалась до Новодевичьего проезда, где водитель господина Калмановича из-за ранения уже не смог справиться с управлением и вылетел с дороги.

В совершении этого преступления теперь обвиняются ранее судимые уроженцы Ингушетии Багаутдин Костоев, Батыр Тумгоев и Али Белхороев (Али Боксер).

Всем им предъявлено обвинение в убийстве (ст. 105 УК РФ) и покушении на убийство (ст. 30 и ст. 105 УК РФ), а также незаконном обороте оружия (ст. 222 УК РФ). Господин Костоев, по версии следствия, был исполнителем преступления, Али Боксер находился за рулем «Приоры», а его земляк Тумгоев координировал их действия по телефону, находясь рядом, но в другом автомобиле. Помимо этого, господину Тумгоеву ранее было предъявлено также обвинение в разбойном нападении (ст. 162 УК РФ), совершенном в январе 2004 года на министра московского правительства, главу департамента по науке и промышленной политике Евгения Пантелеева. У чиновника подсудимый, по версии следствия, вместе с двумя земляками, угрожая ножом, отобрал Gelendеwagen, сняв при этом с водителя и золотые часы (машину милиционерам удалось задержать и вернуть потерпевшему в тот же день). Но уголовное преследование Томгоева по этому эпизоду недавно было прекращено по нереабилитирующему основанию — в связи с истечением срока давности.

Отметим, что, по данным следствия, Шабтая Калмановича злоумышленникам удалось убить с третьей попытки. До этого дважды преступники устраивали засаду у его офиса, но уезжали, так и не дождавшись появления бизнесмена. Примечательно, что для слежки за господином Калмановичем они даже арендовали квартиру напротив офиса предпринимателя.

Мотив преступления официально так и не установлен, но следствие, судя по материалам дела, активно отрабатывало, в частности, версию о том, что расстрел Шабтая Калмановича мог быть связан с конфликтом вокруг одного из предприятий в Видном. Впрочем, доказательств этому следствию найти не удалось.

Подсудимые вины не признают и отрицают какую-либо причастность к убийству предпринимателя.